护国仁王禅寺始建于南宋淳佑五年（1245），清嘉庆八年（1803）重建，历年来经过多次改建。历史上的护国寺作为“尺八祖庭”和中国与日本古代音乐文化交流的历史遗存具有较高的历史文化价值。尺八是中国古代的吹管乐器，唐代传入日本，但为时不久就在日本失传。南宋时，日本名僧心地觉心于宝佑元年（1253）到杭州护国仁王禅寺拜高僧无门慧开习禅，同时在护国寺学会了吹奏尺八的技艺。心地觉心回国后，在日本建兴国寺，立普化宗，把中国尺八技艺传到了日本，从此尺八在日本得到广泛的传播，一直延续至今，成为日本最具代表性的民族乐器。日本并将杭州护国仁王禅寺作为日本尺八的祖庭。